Analyser, Anticiper, Surveiller et Conserver

Base de données, on y trouve :

Des rapports :

Objectifs du Volet 4

  • Préparer le plan de gestion des données
  • Nettoyer et valider les données acquises
  • Intégrer et stocker les données dans la base de données DYLAQ
  • Diffuser les données (dataInrae)
  • Mettre à disposition les données pour le volet 5 : Communication/Transfert

Données dans Vigie-Lacs

Cycle de la donnée

Planification

Toutes sortes de produits de la recherche.

Volet 4
  • jeux de données
  • logiciel
  • workflows
  • échantillons
  • protocoles
  • scripts

Création

Des données créées

  • fetch (la distance en eau) sur les différents points du plan d’eau
    Volet 3
    • pour la remise en suspension
    • pour le calcul de l’indice de Keddy
  • en test bathymétrie du lac
    Volet 3
    • problématique de la volumétrie (format NetCDF)
    • idée partir sur un stockage S3

Collecte des données

Décrire les données et les métadonnées

  • protocoles dans Protocols.io
    Volet 1
    • en test : Macrophyte_Circle, (diversité génétique)
  • récupération des métadatas des instruments de mesure
    Volet 1
    • optodes et tinytag

Traitement

Qualification des données

  • script R sur les données optodes et tinytag
  • discussion en cours avec les agents du Pôle ECLA sur les critères de qualification

Analyse des données

Des analyses à partager

Codes R :

  • format package

  • disponible sur

  • documentation des fonctions

Stocker

Base de données

  • Alimentation de la base de données
  • Création de nouveaux schémas
    • fetch
    • hight_frequency : optodes et tinytag
    • en recherche de solution bathymetrie
    • en cours quadrat roselière
  • Description : dictionnaire de données
    • en cours Macrophyte : vocabulaire controlé (référentiel : Sandre, GBif, Taxref)

  • en test standard de métadata : EML (Ecological Metadata Language)

Volet 4

Merci de votre attention !

Crédits :

  • éléments du projet Vige-Lacs : C. Fortin
  • logos diapo 2 : V. Bertrin
  • logos diapo 4 : Phylopic
  • documents DYLAQ : A. Jamoneau et al.
  • graphique bathymétrie : A. Pryet
  • graphique accessibilité : R. Wunderlich